Killy continua a sua aventura pela Megaestrutura em busca do Gene-Modem, que permite humanos a acessarem a Internet e ao mundo virtual – a NetSphere. Em um dos níveis, ele consegue a informação de que pode encontrar um engenheiro genético na tal Metrópole Kaito, local onde há uma considerável concentração de pessoas. Lá, Killy descobre sobre um centro de pesquisas chamado Seidensha, e é onde pode estar a resposta definitiva para a sua busca. Porém, o preço que ele terá que pagar pela tão desejada informação pode ser muito maior do que imagina…!